Династия Гогенштауфенов в Сицилии 1194—1268 годах: император Генрих VI 1194—1197; император Фридрих II 1197—1250; Манфред 1258-1266; Конрадин 1258-1268
Наиболее одаренным правителем Королевства обеих Сицилий был Фридрих II. Ему пришлось потратить немало усилий, чтобы покончить с анархией, воцарившейся в королевстве во время его малолетства. Он смирил феодалов южной Италии, разорил их замки, организовал управление королевством на совершенно новой основе.

В 1231 году издал т. н. Мельфийские конституции (их еще называют Liber augustalis, т.е. Императорской книгой) — новый свод законов, которые далеко опередили свое время, поскольку превращали Сицилию в абсолютистское государство с мощной бюрократической машиной, продуманной налоговой системой и фактически упраздненными феодальными вольностями. Фридрих всячески содействовал развитию торговли, заключил ряд торговых договоров на Востоке, поощрял местное земледелие и промышленность, не полагаясь на феодальные ополчения, организовал постоянную армию, создал сильный флот. Всё это сделало королевство могучей военной державой. При этом Фридрих был самым образованным из государей своего времени. Хорошо знал арабских и греческих писателей и читал их в подлиннике. Его окружали византийские, арабские, еврейские ученые. Сам не чурался литературных трудов: написал трактат о соколиной охоте, писал по-итальянски стихи, основал университет в Неаполе и поддерживал медицинскую школу в Салерно. Был совершенно равнодушен к вопросам религии, терпимо относился ко всем вероисповеданиям. Имел прекрасные отношения с мусульманскими соседями.

После смерти Фридриха II трон сицилийского королевства занял его сын Манфред (1232—26 февраля 1266). В битве при Беневенто 26 февраля 1266 года с армией вторшегося на юг Италии Карла Анжуйского, брата французского короля Людовика IX, он погиб. Тогда итальянские гибеллины (представители политческого течения выступали за ограничение власти императора Священной Римской империи в Италии и усиление влияния папы римского) при поддержке враждебной Карлу сицилийской знати предложили внуку императора Фридриха II, племяннику Манфреда, герцогу Швабии Конрадину вступить во владение отцовскими землями в Италии (Манфред правил Сицилией от его имени). Осенью 1267 года с наёмным войском он перешел Альпы. Сначала ему сопутствовала удача: битва против французов в долине Арно была выиграна, Рим в июле 1268 года приветствовал его как императора, в Сицилии разгорелось восстание в его пользу, но в решающей битве при Тальякоццо к северо-востоку от Рима 23 августа 1268 года 3500 — 4000 французских рыцарей, благодаря своей дисциплине, победили смешанное наемное войско Конрадина (4500 — 5500 человек); последний сначала смог бежать, но в начале сентября был взят в плен и выдан Карлу.

Его судили как изменника и вместе с Фридрихом Баденским и 11 другими сторонниками казнили на рыночной площади в Неаполе 29 октября 1268 года. Так завершилась династия Гогенштауфенов в королевстве обеих Сицилий