Весной 1258 года, невзирая на плохой урожай прошлого года и голод, король потребовал у баронов треть доходов всей страны. И хотя ещё в 1235 году король издал так называемый «мертонский статут» — постановление разрешающее лордам производить огораживание общинных пустошей, если у свободных крестьян остается после этого достаточно общинной земли, бароны всё равно взбунтовались, разработали и предоставили королю так называемые «Оксфордские провизии», в которых власть короля ограничивалсь баронами, без согласия которых он не мог принимать решений. Впрочем, «Оксфордские провизии» были полезны только могущественным феодалам, но не учитывали нужд мелких рыцарей и горожан.
Воспользовавшись противоречиями с стане врагов, король отказался от исполнения «Оксфордских провизий». Началась гражданская война. В 1263 году в битве при Льюисе королевские войска потерпели поражение. Генрих, его сын Эдуард попали в плен. В 1265 году в Англии стараниями победителя при Льюисе Симона де Монфора был созван первый парламент. Впрочем, среди баронов тоже не было согласия, противоречия в их стане тоже имели место быть. Воспользовавшись этим, убежавший из плена Эдуард возобновил войну, которая продолжалась еще два года, но постепенно сторонники короля восторжествовали во всех графствах. Лондон без боя открыл ворота перед победителями. В 1267 году был заключен договор, успокоивший государство. Великая Хартия была восстановлена, противники короля получили полную амнистию, все стеснительные ограничения королевской власти, введенные в 1258 году, были отменены. В последние годы своего правления король Генрих Третий усердно заботился о правосудии и о наведении порядка в правительственном хозяйстве. Он соблюдал Великую Хартию вольностей, принимал постановления парламента и замещал государственные должности исключительно англичанами