Первый представитель новой династии Конрад III должен был вынести тяжелую борьбу из-за укрепления своей власти в Германии с Генрихом Гордым из фамилии Ведьфов, герцогом Саксонии и Баварии. В конце концов Конраду III удалось справиться с сильным герцогом и передать своему преемнику более или менее успокоенную Германию. Из внешних предприятий Конрада III можно отметить его участие во втором крестовом походе, который был предпринят для освобождения Святых Мест из рук неверных, но, кроме потерь и расходов, ничего Германии не принес. Преемником Конрада стал его племянник (сын Фридриха Одноглазого) Фридрих I Барбаросса.
При сыне и наследнике Фридриха Генрихе VI Гогенштауфены достигли вершины своего могущества, и хотя Генриху не удалось провести закон о наследственной передаче короны в роде Гогенштауфенов, все же его двухлетний сын Фридрих был провозглашен его преемником (1196 год). Генрих VI умер рано, когда его сыну Фридриху II было всего три года. Потому годы, пока Фридрих мужал, было временем борьбы за корону разных сил и личностей, в которую активно вмешивались и римские папы. Фридрих II был Римским императором, королем Германии и Италии с 1220 по 1250 годы, считающиеся самыми благополучными в истории Гогенштауфенов. Фридрих умер в 1250 году, быстро сошли в могилу и его наследники.
Последним 29 октября 1268 году погиб внук Фридриха Конрадин (род. 25 марта 1252). Он пытался отбить свои владения в Сицилии у захватившего остров Карла I Анжуйского, но в решающей битве при Тальякоццо к северо-востоку от Рима, 23 августа 1268 года, 3500 — 4000 французских рыцарей, благодаря своей дисциплине, победили смешанное наемное войско Конрадина (4500 — 5500 человек); последний сначала смог бежать, но в начале сентября был взят в плен и выдан Карлу. Его судили как изменника и вместе с 11 другими сторонниками казнили на рыночной площади в Неаполе. Гогенштауфены стали последней мощной династии Священной Римской империи. С угасанием их рода начался упадок империи, и, хотя в том или ином виде империя существовала ещё на протяжении более пяти столетий, суверенитет империи ограничивался теперь одной Германией, так как от нее отпали Италия и Бургундия, и она получила новое название – Священная Римская империя немецкой нации. Последние связи с папским престолом прервались к концу 15 века, когда германские короли взяли за правило принимать титул императора, не отправляясь в Рим для получения короны из рук папы