Стал королем после смерти отца Генриха IV, убитого 14 мая 1610 года. В малолетстве регеншей была его мать Мария Медичи. Власть над Францией получил только после смерти фаворита королевы-матери Кончито Кончини в 1617 году (считается, что наемного убийцу Кончини он и подослал). 3 года выдерживал претензии матери, которая плела против него интриги, устраивала заговоры и даже инициировала вооруженный мятеж, закончившийся поражением её армии в битве при Понт-де-Се 7 апреля 1620 года.
В 1624 году у руля Франции стал кардинал Ришилье. Он и король имели одинаковые взгляды на внешнюю и внутреннюю политику, совместно боролись против гугенотов, Испании, проводили рационализацию административной системы. Во время царствования Людовика XIII Франция участвовала в войне в Северной Италии 1624—1625 годов, войне с Испанией 1635—1659 годов за господство в Европе, Тридцатилетней (1618—1648). Были подавлены восстания гугенотов на юго-западе Франции в 1621-1622, 1625, 1627-1629 годах, права которых Людовик-ревностный приверженец Римско-котолической церкви, пытался нарушать. Сопротивление протестантов было сломлено после капитуляции крепости Ла-Рошель, осада каторой продолжалась с 10 сентября 1627 по 28 октября 1628 год.
28 июня 1629 года в городе Алесе между Людовиком XIII и лидерами гугенотов был подписан мирный договор. Он подтвердил основные принципы Нантского эдикта, однако лишал гугенотов политических прав, и требовал немедленного отказа от всех городов и крепостей. Годы правления Людовика XIII и кардинала Ришилье — время ещё большего укрепления абсолютизма во Франции