Контроль над островом Зеландия позволил Северным Нидерландам установить контроль движение судов через устье Шельды, которая связывала с морем важный порт Антверпен. Антверпен оказался в блокаде. Чем воспользовался порт Амстердама, ставший центром европейской транзитной торговли. В 1600 году Мориц Наусский предпринял поход в Южные Нидерланды, но не преспел. 2 июля 1600 года битва близ Ньюпорта, города в Западной Фландрии, не принесла успеха ни одной из строн. В 1601 году испанцы окружили Остенде и взяли его после трехлетней осады. Затраты на оборону города проделали серьёзную брешь в финансах Нидерландов, в армии Испании, не получая жалования, бунтовали наёмники.
К 1607 году у противоборствующих сторон не было ни сил, ни финансовых возможностей продолжать боевые действия. Испания и Голландия начали тайные контакты для достижения мира. Условиями голландской стороны были признание республики суверенным государством, разрешение торговли в обеих Индиях и запрет католического богослужения. Вопрос независимости республики был быстро урегулирован, однако проблема торговли в Индиях и свобода католического вероисповедания стали камнем преткновения. Стороны стали готовиться к возобновлению боевых действий, но французский посланник Пьер Жанни спас ситуацию. Он предложил в качестве компромисса двенадцатилетнее перемирие, оставив при этом открытыми вопросы, по которым к соглашению прийти не удалось. Перемирие сроком на 12 лет было подписано между Испанией и Соединенными провинциями 9 апреля 1609 года в Антверпене. По его условиям Испания признала де-факто независимость Соединённых провинций и их право вести торговлю с бывшими португальскими колониями в бассейне Индийского океана. Устье реки Шельды объявлялось закрытым для торговли, что способствовало подъёму экономики Амстердама и разорению конкурировавшего с ним Антверпена