В своих владениях проводил политику централизации, опираясь на церковь и города, которым он предоставлял широкие привилегии, что вызвало недовольство местной знати. Активно заботился Отакар о развитии внутренней жизни Чехии. Содействовал торговле, проводил дороги, основывал школы, покровительствовал наукам и искусствам. Для развития торговли, промышленности, особенно горного дела, и для обработки и заселения невозделанных мест приглашал в Чехию в большом количестве немецких колонистов. Последняя мера имела гибельные последствия для Чехии, так как селившиеся там повсюду немцы вводили свой язык и свои обычаи, т. е. содействовали онемечению славянской страны. Последнее обстоятельство сеяло вражду между чехами и немцами. Одновременно Отакар II лелеял надежду самому стать императором.
Но немецкие князья выбрали императором Рудольфа Габсбургского. Рудольф начал методично выдавливать Пржемысла из австрийских владений. 1274-1278 — годы их активного противостояния. Пшемысл, против которого поднялись не только феодалы Австрии, но и свои собственные, в 1275 году вынужден был искать мира с условиях отказа от всех своих владений, кроме Чехии и Моравии, да и те — на правах имперского лена. В 1278 году, не договорившись, Пшемысл с 30-тысячной армией вторгся в Австрию и 26 августа в сражении близ Сухих Крут был убит. Со смертью Пржемысла Отакара II закончилось краткое доминирование чехов в Австрии. На смену им пришли Габсбурги